Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	YTP1	YNL237W	1380 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	DIN7	YDR263C	1293 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	MOB2	YFL034C-B	864 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	VPS1	YKR001C	2115 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	MEH1	YKR007W	555 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	PDR16	YNL231C	1056 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	LGE1	YPL055C	999 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	MRL1	YPR079W	1146 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	NUD1	YOR373W	2556 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	ATR1	YML116W	1629 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	DUR1,2	YBR208C	5508 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	MAL13	YGR288W	1422 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	ARE2	YNR019W	1929 nt		5.21	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	ECM3	YOR092W	1842 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	VCX1	YDL128W	1236 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YDR249C	YDR249C	1122 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YGR273C	YGR273C	525 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YNG2	YHR090C	849 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YPL073C	YPL073C	486 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	ERI1	YPL096C-A	207 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	ECM31	YBR176W	939 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	ABD1	YBR236C	1311 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	GUA1	YMR217W	1578 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	ISN1	YOR155C	1353 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	PPH21	YDL134C	1110 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	MSP1	YGR028W	1089 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YHR022C	YHR022C	771 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YLR124W	YLR124W	345 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	GTR1	YML121W	933 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	COS10	YNR075W	1125 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YPL136W	YPL136W	369 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YMC1	YPR058W	924 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	HXT3	YDR345C	1704 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	COX15	YER141W	1461 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	MNN2	YBR015C	1794 nt		5.19	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	MID2	YLR332W	1131 nt		5.19	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	AAD14	YNL331C	1131 nt		5.19	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	HRT1	YOL133W	366 nt		5.19	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	AME1	YBR211C	975 nt		5.19	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	ERC1	YHR032W	1746 nt		5.19	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	UBX2	YML013W	1755 nt		5.19	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	IML2	YJL082W	2196 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	VMA13	YPR036W	1437 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YDL026W	YDL026W	312 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	HSP31	YDR533C	714 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	MRP13	YGR084C	1020 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YHR070C-A	YHR070C-A	411 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	MRPL6	YHR147C	645 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	RPL10	YLR075W	666 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YMR119W-A	YMR119W-A	375 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	IFA38	YBR159W	1044 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	GSH2	YOL049W	1476 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	RET1	YOR207C	3450 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	EXG1	YLR300W	1347 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	URA3	YEL021W	804 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	SCL1	YGL011C	759 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	URA1	YKL216W	945 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YLL059C	YLL059C	507 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	BLS1	YLR408C	369 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	SSP2	YOR242C	1116 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	NRG2	YBR066C	663 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YPR160C-A	YPR160C-A	285 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	SMF3	YLR034C	1422 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	UTP4	YDR324C	2331 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YDR222W	YDR222W	1248 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	RPT3	YDR394W	1287 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YHR214W	YHR214W	612 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YIL047C-A	YIL047C-A	369 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YLR036C	YLR036C	612 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YAR066W	YAR066W	612 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	YMR086C-A	YMR086C-A	339 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	IRC14	YOR135C	342 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	SPE3	YPR069C	882 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	PIF1	YML061C	2580 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	CCT8	YJL008C	1707 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	ASH1	YKL185W	1767 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	HOF1	YMR032W	2010 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	MID1	YNL291C	1647 nt		5.15	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	RFA1	YAR007C	1866 nt		5.15	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	AMD2	YDR242W	1650 nt		5.15	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	PKC1	YBL105C	3456 nt		5.15	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	HXT5	YHR096C	1779 nt		5.15	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	MPP10	YJR002W	1782 nt		5.15	□□□□□ -1.58
SIP1	P32578	CAF16	YFL028C	870 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	ADH4	YGL256W	1149 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	HOC1	YJR075W	1191 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YLR225C	YLR225C	1224 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	MET16	YPR167C	786 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	UBS1	YBR165W	834 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	TAX4	YJL083W	1815 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	RRN3	YKL125W	1884 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YPK3	YBR028C	1578 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YME1	YPR024W	2244 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	RPS31	YLR167W	459 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	GTO3	YMR251W	1101 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	LTO1	YNL260C	597 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YSA1	YBR111C	696 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	PTC4	YBR125C	1182 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	ATP1	YBL099W	1638 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	COR1	YBL045C	1374 nt		5.14	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.2 ms