Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DMAP28067 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLA-DMAP28067 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms