Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTNP21246 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTNP21246 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTNP21246 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTNP21246 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTNP21246 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTNP21246 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTNP21246 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTNP21246 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTNP21246 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTNP21246 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTNP21246 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTNP21246 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTNP21246 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTNP21246 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTNP21246 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTNP21246 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTNP21246 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTNP21246 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTNP21246 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTNP21246 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTNP21246 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTNP21246 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTNP21246 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTNP21246 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTNP21246 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTNP21246 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTNP21246 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTNP21246 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTNP21246 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTNP21246 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTNP21246 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTNP21246 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTNP21246 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTNP21246 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTNP21246 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTNP21246 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTNP21246 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTNP21246 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTNP21246 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTNP21246 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTNP21246 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTNP21246 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTNP21246 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTNP21246 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTNP21246 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTNP21246 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTNP21246 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTNP21246 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTNP21246 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTNP21246 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTNP21246 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTNP21246 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTNP21246 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTNP21246 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTNP21246 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTNP21246 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTNP21246 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTNP21246 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTNP21246 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTNP21246 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTNP21246 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTNP21246 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTNP21246 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTNP21246 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTNP21246 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTNP21246 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTNP21246 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTNP21246 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTNP21246 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTNP21246 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTNP21246 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTNP21246 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTNP21246 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTNP21246 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTNP21246 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTNP21246 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTNP21246 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PTNP21246 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTNP21246 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTNP21246 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTNP21246 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTNP21246 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTNP21246 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTNP21246 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTNP21246 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTNP21246 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTNP21246 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTNP21246 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTNP21246 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTNP21246 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTNP21246 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTNP21246 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTNP21246 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTNP21246 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTNP21246 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTNP21246 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTNP21246 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTNP21246 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTNP21246 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms