Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LMNB1P20700 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms