Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF2P19878 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCF2P19878 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCF2P19878 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCF2P19878 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCF2P19878 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCF2P19878 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCF2P19878 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCF2P19878 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCF2P19878 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCF2P19878 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCF2P19878 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCF2P19878 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCF2P19878 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCF2P19878 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCF2P19878 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCF2P19878 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCF2P19878 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCF2P19878 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCF2P19878 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCF2P19878 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF2P19878 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF2P19878 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF2P19878 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF2P19878 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF2P19878 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF2P19878 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF2P19878 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF2P19878 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF2P19878 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF2P19878 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF2P19878 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCF2P19878 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCF2P19878 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCF2P19878 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCF2P19878 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCF2P19878 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCF2P19878 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCF2P19878 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCF2P19878 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF2P19878 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF2P19878 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF2P19878 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF2P19878 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF2P19878 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF2P19878 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF2P19878 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF2P19878 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCF2P19878 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCF2P19878 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCF2P19878 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCF2P19878 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCF2P19878 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCF2P19878 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCF2P19878 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCF2P19878 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCF2P19878 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCF2P19878 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCF2P19878 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCF2P19878 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCF2P19878 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCF2P19878 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCF2P19878 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCF2P19878 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCF2P19878 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCF2P19878 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCF2P19878 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCF2P19878 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCF2P19878 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NCF2P19878 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCF2P19878 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCF2P19878 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCF2P19878 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCF2P19878 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCF2P19878 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCF2P19878 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCF2P19878 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCF2P19878 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCF2P19878 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCF2P19878 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCF2P19878 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCF2P19878 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCF2P19878 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCF2P19878 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCF2P19878 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCF2P19878 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCF2P19878 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCF2P19878 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCF2P19878 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCF2P19878 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCF2P19878 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCF2P19878 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCF2P19878 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCF2P19878 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCF2P19878 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCF2P19878 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCF2P19878 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCF2P19878 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCF2P19878 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCF2P19878 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms