Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH2P19022 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH2P19022 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH2P19022 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH2P19022 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH2P19022 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH2P19022 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH2P19022 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH2P19022 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH2P19022 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH2P19022 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH2P19022 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH2P19022 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH2P19022 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH2P19022 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH2P19022 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH2P19022 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH2P19022 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH2P19022 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH2P19022 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH2P19022 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH2P19022 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH2P19022 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH2P19022 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH2P19022 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH2P19022 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH2P19022 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH2P19022 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH2P19022 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH2P19022 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH2P19022 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH2P19022 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH2P19022 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH2P19022 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH2P19022 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH2P19022 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH2P19022 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH2P19022 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH2P19022 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH2P19022 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH2P19022 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH2P19022 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH2P19022 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH2P19022 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH2P19022 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH2P19022 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH2P19022 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH2P19022 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH2P19022 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH2P19022 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH2P19022 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH2P19022 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH2P19022 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH2P19022 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH2P19022 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH2P19022 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH2P19022 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH2P19022 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH2P19022 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH2P19022 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH2P19022 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH2P19022 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH2P19022 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH2P19022 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH2P19022 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH2P19022 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH2P19022 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH2P19022 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH2P19022 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH2P19022 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH2P19022 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH2P19022 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH2P19022 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH2P19022 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH2P19022 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH2P19022 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH2P19022 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH2P19022 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH2P19022 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH2P19022 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH2P19022 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH2P19022 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH2P19022 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH2P19022 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH2P19022 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH2P19022 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH2P19022 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH2P19022 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH2P19022 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH2P19022 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH2P19022 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH2P19022 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH2P19022 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDH2P19022 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH2P19022 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH2P19022 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH2P19022 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH2P19022 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH2P19022 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH2P19022 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms