Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF35P13682 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.9 ms