Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM13P0DJ93 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms