Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFRBP09619 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRBP09619 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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