Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGRP06401 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGRP06401 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGRP06401 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGRP06401 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGRP06401 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGRP06401 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGRP06401 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGRP06401 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGRP06401 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGRP06401 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGRP06401 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGRP06401 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRP06401 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRP06401 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRP06401 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRP06401 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRP06401 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRP06401 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRP06401 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRP06401 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRP06401 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRP06401 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRP06401 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRP06401 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRP06401 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRP06401 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRP06401 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRP06401 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGRP06401 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGRP06401 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGRP06401 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGRP06401 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGRP06401 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGRP06401 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGRP06401 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGRP06401 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGRP06401 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGRP06401 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRP06401 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRP06401 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRP06401 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRP06401 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRP06401 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRP06401 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRP06401 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRP06401 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRP06401 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRP06401 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRP06401 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRP06401 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRP06401 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRP06401 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRP06401 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRP06401 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRP06401 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRP06401 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRP06401 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRP06401 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRP06401 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRP06401 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRP06401 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRP06401 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRP06401 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRP06401 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRP06401 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRP06401 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRP06401 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRP06401 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGRP06401 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGRP06401 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGRP06401 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGRP06401 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGRP06401 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGRP06401 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGRP06401 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGRP06401 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGRP06401 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGRP06401 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGRP06401 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGRP06401 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGRP06401 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGRP06401 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGRP06401 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms