Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	YGR125W	YGR125W	3111 nt		4.29	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	GIP2	YER054C	1647 nt		4.29	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	SIF2	YBR103W	1608 nt		4.29	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	HEM3	YDL205C	984 nt		4.29	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	SSY5	YJL156C	2100 nt		4.29	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	DOA1	YKL213C	2148 nt		4.29	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	AAD15	YOL165C	432 nt		4.29	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	BUB3	YOR026W	1026 nt		4.29	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	CSG2	YBR036C	1233 nt		4.29	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	RPS9A	YPL081W	594 nt		4.29	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	ENV7	YPL236C	1095 nt		4.29	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	RIM15	YFL033C	5313 nt		4.29	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	STP4	YDL048C	1473 nt		4.29	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	COR1	YBL045C	1374 nt		4.28	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	ARB1	YER036C	1833 nt		4.28	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	RPT4	YOR259C	1314 nt		4.28	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	MRF1	YGL143C	1242 nt		4.28	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	RRP4	YHR069C	1080 nt		4.28	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	ZRT2	YLR130C	1269 nt		4.28	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	YPR098C	YPR098C	486 nt		4.28	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	PEX32	YBR168W	1242 nt		4.28	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	RAD16	YBR114W	2373 nt		4.28	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	YIL060W	YIL060W	435 nt		4.27	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	PRE3	YJL001W	648 nt		4.27	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	RPS15	YOL040C	429 nt		4.27	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	PSH1	YOL054W	1221 nt		4.27	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	GAL4	YPL248C	2646 nt		4.27	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	YMD8	YML038C	1329 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	MNS1	YJR131W	1650 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	HOF1	YMR032W	2010 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	TRK2	YKR050W	2670 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	YDL022C-A	YDL022C-A	249 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	YGR016W	YGR016W	573 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	HST2	YPL015C	1074 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	ATG12	YBR217W	561 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	MKC7	YDR144C	1791 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	FZO1	YBR179C	2568 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	NUP116	YMR047C	3342 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	NGR1	YBR212W	2019 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	UGA1	YGR019W	1416 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	HCR1	YLR192C	798 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	PRP46	YPL151C	1356 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	YDR261C-D	YDR261C-D	4815 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	SEG2	YKL105C	3399 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	UBP9	YER098W	2265 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	SEC12	YNR026C	1416 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	PMA1	YGL008C	2757 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	DFM1	YDR411C	1026 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	YEA6	YEL006W	1008 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	ECM19	YLR390W	339 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	SPG4	YMR107W	348 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	MRK1	YDL079C	1506 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	STL1	YDR536W	1710 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	HAP1	YLR256W	4509 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	CDC4	YFL009W	2340 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	SYG1	YIL047C	2709 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	MSE1	YOL033W	1611 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	MOT2	YER068W	1764 nt		4.22	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	SNT2	YGL131C	4212 nt		4.22	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	YCL065W	YCL065W	369 nt		4.22	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	YRA1	YDR381W	681 nt		4.22	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	TIF2	YJL138C	1188 nt		4.22	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	SFK1	YKL051W	1062 nt		4.22	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	TIF1	YKR059W	1188 nt		4.22	□□□□□ -1.73
VAR1	P02381	PRS2	YER099C	957 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	PGA2	YNL149C	390 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	TGS1	YPL157W	948 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	TEF1	YPR080W	1377 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	TEF2	YBR118W	1377 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	FRE1	YLR214W	2061 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	BUL1	YMR275C	2931 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	ARO10	YDR380W	1908 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	ABF1	YKL112W	2196 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	FHL1	YPR104C	2811 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	PDI1	YCL043C	1569 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	SUR2	YDR297W	1050 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	YHR193C-A	YHR193C-A	375 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	YLR126C	YLR126C	756 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	SSZ1	YHR064C	1617 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	LYS21	YDL131W	1323 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	KRS1	YDR037W	1776 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	PDH1	YPR002W	1551 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	SLT2	YHR030C	1455 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	CLF1	YLR117C	2064 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	PAN6	YIL145C	930 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	SPO7	YAL009W	780 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	FMP33	YJL161W	543 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	YKR041W	YKR041W	753 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	CSR1	YLR380W	1227 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	BIT2	YBR270C	1638 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	ORC5	YNL261W	1440 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	YGR266W	YGR266W	2106 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	PUF3	YLL013C	2640 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	VHC1	YBR235W	3363 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	YCR047W-A	YCR047W-A	207 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	RPS16B	YDL083C	432 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	MTQ2	YDR140W	666 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	RML2	YEL050C	1182 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	TDA7	YNL176C	1911 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	SHM1	YBR263W	1473 nt		4.18	□□□□□ -1.74

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