Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
F13A1P00488 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
F13A1P00488 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
F13A1P00488 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
F13A1P00488 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
F13A1P00488 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
F13A1P00488 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
F13A1P00488 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
F13A1P00488 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
F13A1P00488 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
F13A1P00488 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
F13A1P00488 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
F13A1P00488 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
F13A1P00488 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
F13A1P00488 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
F13A1P00488 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
F13A1P00488 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
F13A1P00488 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
F13A1P00488 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
F13A1P00488 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
F13A1P00488 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
F13A1P00488 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
F13A1P00488 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
F13A1P00488 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
F13A1P00488 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
F13A1P00488 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
F13A1P00488 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
F13A1P00488 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
F13A1P00488 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
F13A1P00488 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
F13A1P00488 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
F13A1P00488 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
F13A1P00488 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
F13A1P00488 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
F13A1P00488 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
F13A1P00488 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
F13A1P00488 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
F13A1P00488 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
F13A1P00488 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
F13A1P00488 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
F13A1P00488 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
F13A1P00488 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
F13A1P00488 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
F13A1P00488 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
F13A1P00488 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
F13A1P00488 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
F13A1P00488 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
F13A1P00488 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
F13A1P00488 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
F13A1P00488 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
F13A1P00488 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
F13A1P00488 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
F13A1P00488 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
F13A1P00488 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
F13A1P00488 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
F13A1P00488 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
F13A1P00488 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
F13A1P00488 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
F13A1P00488 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
F13A1P00488 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
F13A1P00488 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
F13A1P00488 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
F13A1P00488 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
F13A1P00488 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
F13A1P00488 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
F13A1P00488 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
F13A1P00488 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
F13A1P00488 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
F13A1P00488 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
F13A1P00488 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
F13A1P00488 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
F13A1P00488 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
F13A1P00488 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
F13A1P00488 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
F13A1P00488 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
F13A1P00488 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
F13A1P00488 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
F13A1P00488 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
F13A1P00488 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
F13A1P00488 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
F13A1P00488 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
F13A1P00488 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
F13A1P00488 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
F13A1P00488 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
F13A1P00488 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
F13A1P00488 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
F13A1P00488 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
F13A1P00488 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
F13A1P00488 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
F13A1P00488 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
F13A1P00488 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
F13A1P00488 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
F13A1P00488 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
F13A1P00488 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
F13A1P00488 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
F13A1P00488 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
F13A1P00488 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
F13A1P00488 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
F13A1P00488 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
F13A1P00488 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms