Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAMBPO95630 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPO95630 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms