Protein–RNA interactions for Protein: O75351

VPS4B, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4BO75351 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS4BO75351 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS4BO75351 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms