Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX3O60493 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX3O60493 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX3O60493 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX3O60493 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX3O60493 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX3O60493 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX3O60493 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX3O60493 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX3O60493 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX3O60493 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX3O60493 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX3O60493 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX3O60493 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX3O60493 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX3O60493 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX3O60493 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX3O60493 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX3O60493 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX3O60493 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX3O60493 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX3O60493 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX3O60493 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX3O60493 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SNX3O60493 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX3O60493 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX3O60493 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX3O60493 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX3O60493 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX3O60493 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX3O60493 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX3O60493 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX3O60493 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX3O60493 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX3O60493 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX3O60493 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX3O60493 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX3O60493 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX3O60493 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX3O60493 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX3O60493 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX3O60493 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX3O60493 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX3O60493 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX3O60493 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX3O60493 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX3O60493 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX3O60493 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX3O60493 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX3O60493 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX3O60493 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX3O60493 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX3O60493 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX3O60493 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX3O60493 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX3O60493 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX3O60493 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX3O60493 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX3O60493 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX3O60493 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX3O60493 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX3O60493 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX3O60493 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX3O60493 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX3O60493 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX3O60493 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX3O60493 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX3O60493 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX3O60493 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX3O60493 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX3O60493 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX3O60493 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX3O60493 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX3O60493 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX3O60493 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX3O60493 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX3O60493 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX3O60493 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX3O60493 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX3O60493 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX3O60493 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX3O60493 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SNX3O60493 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX3O60493 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX3O60493 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX3O60493 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX3O60493 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX3O60493 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX3O60493 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX3O60493 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX3O60493 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX3O60493 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX3O60493 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX3O60493 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX3O60493 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX3O60493 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX3O60493 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX3O60493 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX3O60493 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX3O60493 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms