Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CYTH3O43739 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYTH3O43739 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYTH3O43739 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms