Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSC2O15499 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSC2O15499 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSC2O15499 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSC2O15499 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSC2O15499 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSC2O15499 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSC2O15499 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSC2O15499 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSC2O15499 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSC2O15499 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSC2O15499 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSC2O15499 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSC2O15499 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSC2O15499 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSC2O15499 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSC2O15499 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSC2O15499 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSC2O15499 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSC2O15499 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSC2O15499 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSC2O15499 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSC2O15499 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSC2O15499 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSC2O15499 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSC2O15499 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSC2O15499 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSC2O15499 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
GSC2O15499 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GSC2O15499 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GSC2O15499 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSC2O15499 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSC2O15499 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSC2O15499 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSC2O15499 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSC2O15499 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSC2O15499 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSC2O15499 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSC2O15499 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSC2O15499 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSC2O15499 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSC2O15499 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSC2O15499 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSC2O15499 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSC2O15499 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSC2O15499 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSC2O15499 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSC2O15499 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GSC2O15499 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSC2O15499 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSC2O15499 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSC2O15499 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSC2O15499 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSC2O15499 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSC2O15499 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSC2O15499 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSC2O15499 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSC2O15499 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSC2O15499 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSC2O15499 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GSC2O15499 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSC2O15499 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSC2O15499 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSC2O15499 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSC2O15499 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSC2O15499 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSC2O15499 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSC2O15499 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSC2O15499 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GSC2O15499 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSC2O15499 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSC2O15499 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSC2O15499 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSC2O15499 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSC2O15499 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSC2O15499 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSC2O15499 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSC2O15499 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSC2O15499 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSC2O15499 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSC2O15499 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSC2O15499 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSC2O15499 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSC2O15499 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSC2O15499 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSC2O15499 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSC2O15499 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSC2O15499 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSC2O15499 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSC2O15499 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSC2O15499 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSC2O15499 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GSC2O15499 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSC2O15499 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSC2O15499 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSC2O15499 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GSC2O15499 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSC2O15499 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSC2O15499 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSC2O15499 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms