Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLK1O15075 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms