Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
J3QKU1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
J3QKU1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
J3QKU1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
J3QKU1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
J3QKU1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
J3QKU1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
J3QKU1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21■□□□□ 0.95
J3QKU1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
J3QKU1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
J3QKU1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
J3QKU1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
J3QKU1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
J3QKU1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
J3QKU1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
J3QKU1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
J3QKU1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
J3QKU1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3QKU1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3QKU1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3QKU1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
J3QKU1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3QKU1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3QKU1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3QKU1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3QKU1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3QKU1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
J3QKU1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
J3QKU1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
J3QKU1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
J3QKU1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
J3QKU1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
J3QKU1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
J3QKU1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
J3QKU1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
J3QKU1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
J3QKU1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3QKU1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3QKU1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3QKU1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3QKU1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3QKU1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3QKU1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3QKU1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3QKU1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
J3QKU1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3QKU1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3QKU1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3QKU1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3QKU1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3QKU1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3QKU1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3QKU1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
J3QKU1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3QKU1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3QKU1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3QKU1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3QKU1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3QKU1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
J3QKU1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3QKU1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
J3QKU1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3QKU1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
J3QKU1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3QKU1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3QKU1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3QKU1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3QKU1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3QKU1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3QKU1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3QKU1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3QKU1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3QKU1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3QKU1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3QKU1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3QKU1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3QKU1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
J3QKU1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3QKU1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
J3QKU1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3QKU1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3QKU1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3QKU1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3QKU1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3QKU1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3QKU1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3QKU1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3QKU1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3QKU1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
J3QKU1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3QKU1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
J3QKU1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
J3QKU1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3QKU1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3QKU1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3QKU1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3QKU1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
J3QKU1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3QKU1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3QKU1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms