Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYSRT1A8MQ03 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms