Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GOLGA6BA6NDN3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms