Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
U3KPZ7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U3KPZ7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U3KPZ7 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 AP000941.1-201ENST00000530198 1388 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 RBM5-AS1-201ENST00000630404 1386 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 C1orf146-202ENST00000370375 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 AC106733.1-201ENST00000624476 1038 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KPZ7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 AP000534.1-201ENST00000444162 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 HSPA8P3-201ENST00000449300 780 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 Metazoa_SRP.26-201ENST00000547793 284 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 AL357093.1-201ENST00000556926 458 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KPZ7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 DYNLT1-203ENST00000367089 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KPZ7 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms