Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms