Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCSK1NQ9UHG2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCSK1NQ9UHG2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms