Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms