Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms