Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms