Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms