Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BHLHE41Q9C0J9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms