Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms