Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHMP4AQ9BY43 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms