Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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