Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SENP8Q96LD8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms