Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC1

VPS39, Vam6/Vps39-like protein, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS39Q96JC1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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VPS39Q96JC1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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VPS39Q96JC1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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VPS39Q96JC1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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VPS39Q96JC1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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VPS39Q96JC1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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VPS39Q96JC1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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VPS39Q96JC1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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VPS39Q96JC1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS39Q96JC1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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