Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms