Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms