Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms