Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC10A4Q96EP9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A4Q96EP9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A4Q96EP9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A4Q96EP9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A4Q96EP9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A4Q96EP9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A4Q96EP9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A4Q96EP9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC10A4Q96EP9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.8 ms