Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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