Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms