Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms