Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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ZNF548Q8NEK5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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ZNF548Q8NEK5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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ZNF548Q8NEK5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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