Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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HERC6Q8IVU3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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HERC6Q8IVU3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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HERC6Q8IVU3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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HERC6Q8IVU3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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HERC6Q8IVU3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC6Q8IVU3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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