Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms