Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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