Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms