Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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