Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHBQ15464 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHBQ15464 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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