Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIN2CQ14957 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms