Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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CHD4Q14839 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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CHD4Q14839 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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CHD4Q14839 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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